O conhecimento da microbiologia intestinal de aves avançou de uma capacidade limitada com uma cultura relativamente simples, até a tentativa de entender complexas interações entre a ave e seu microbioma. Já que o microbioma e o hospedeiro se comunicam e influenciam um ao outro, determinando a saúde, a intensidade de doenças infecciosas e até mesmo o comportamento das aves (Lee et al., 2022).
Mudanças importantes ocorreram nas últimas duas décadas na compreensão das interações das aves com as populações microbianas no trato gastrointestinal. Deixando de estudar populações microbianas intestinais na tentativa de identificar espécies para descrevê-las como organismos vivos em um ecossistema específico. O foco nos últimos anos tem-se voltado para o conceito de microbioma, que observa o comportamento da microbiota e seus metabólitos em um determinado espaço (Berg et al., 2020). Objetivando assim, determinar os principais fatores que alteram o equilíbrio da microbiota intestinal, haja visto a sua influência não só no trato gastrointestinal, mas no organismo animal como um todo.
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